L'histoire commence quelques années avant le bâtiment. En 1804, un groupe appelé Religious Improvement Society commence à se réunir chaque semaine pour des conférences et la prière. Le 27 février 1809, cette société s'organise en église. La Park Street Church décrit ses fondateurs comme un groupe de 26 hommes et femmes, réunis pendant ce qu'elle appelle la vague unitarienne du début du dix-neuvième siècle. Ils étaient attachés à l'enseignement trinitaire et au gouvernement congrégationaliste, c'est-à-dire que chaque communauté dirige ses propres affaires. Le National Park Service le formule ainsi : l'église a été organisée en réaction aux unitariens, qui prenaient le contrôle de nombreuses anciennes églises puritaines. Ce coin de rue est donc né d'une affirmation de foi, dans une ville où le terrain religieux se transformait. Le premier pasteur fut Edward Dorr Griffin, qui prononça une célèbre série de sermons du dimanche soir. Quelques années plus tard, en 1816, Park Street s'unit à la Old South Church pour former la City Mission Society, une société de service social destinée aux pauvres des quartiers urbains de Boston. Dès ses premières années, la communauté associait la doctrine et l'engagement envers autrui.