Aqui está a história que transformou um venerável santuário em uma vitrine. O terreno onde hoje está o santuário já foi a residência de Tsunashige, Senhor de Kofu e irmão mais velho do quinto xogum, Tokugawa Tsunayoshi. Ali também nasceu o sexto xogum, Tsunatoyo, que mais tarde adotou o nome Ienobu. Por causa desse nascimento, o Santuário Nezu tornou-se a divindade protetora de seu local de nascimento, o ubusunagami. O santuário em si é muito anterior ao xogunato. A tradição diz que Yamato Takeru o fundou em Sendagi, e que Ota Dokan, o famoso senhor da guerra, mandou erguer ali edifícios do santuário na era Bunmei. Depois, Tsunayoshi transferiu o santuário de seu antigo local em Sendagi para o terreno atual e, em 1706, construiu novos salões para ele. As divindades cultuadas aqui são Susanoo, Oyamakui e Homuwake, com Okuninushi e Sugawara no Michizane também veneradas ao lado. No período Edo, um templo Tendai chamado Shosen-in atuava como administrador do santuário, que era cultuado como santuário gongen. É por isso que você ainda ouvirá o apelido Nezu Gongen. Há até uma leitura bem-humorada do nome. Um guia de 1662 o descrevia como o Gongen que nunca dorme, um vigia noturno entre os deuses.