Aquí está el rasgo que hizo especial a esta torre. Por encima del piso de observación, en la parte más alta, contaba con un faro real. La mayoría de las torres de la época servían simplemente para contemplar el paisaje. Esta además guiaba a los barcos, y durante mucho tiempo se registró como el faro más alto del mundo. Su forma también forma parte de la historia. Las torres de aquella época solían tener aristas cuadradas, pero esta tiene diez lados. Eso significa que se ve prácticamente igual desde cualquier ángulo. En 1961, cuando había pocos edificios altos cerca, su silueta distintiva podía verse desde el puerto y desde muchas zonas de la ciudad. El faro también cambió con los años. En 1989 pasó a llamarse Faro de la Torre Marina de Yokohama, con una sección superior roja, una sección inferior blanca y una estructura de celosía. La gestión del faro pasó a la ciudad de Yokohama en 2007, y su servicio como faro, que había durado unos cincuenta años, terminó en 2008. En 1990 se completó un sistema de iluminación en color, de modo que, al anochecer, la torre se convirtió en un referente luminoso además de un referente diurno.