Le jardin a changé de mains à plusieurs reprises. Après plusieurs propriétaires, le domaine devint la résidence Shiba de la famille Kii Tokugawa vers la fin de l'époque Edo. En 1875, il passa au ministère de la Maison impériale, et en 1876 il devint un palais détaché, le Shiba Rikyu. C'est de là que vient le nom. Rikyu signifie palais détaché, et Kyu signifie ancien. Le chapitre suivant commença en 1924. En janvier de cette année-là, le jardin fut donné à la ville de Tokyo pour célébrer le mariage du futur empereur Showa. Le terrain fut restauré et remis en ordre. Le 20 avril 1924, il ouvrit au public. Il fut d'abord appelé jardin Kyu Shiba Rikyu, puis, à la fin de l'année, il prit le nom de jardin Kyu Shiba Rikyu Onshi. Onshi signifie don impérial. Le jardin est aujourd'hui un jardin métropolitain de Tokyo, protégé comme bien culturel pour sa valeur artistique et paysagère. Un lieu autrefois réservé à un seigneur, puis à la maison impériale, est désormais ouvert à quiconque y entre.