Hier liegt das Merkmal, das diesen Turm besonders machte. Oberhalb der Aussichtsplattform, ganz oben, trug er einen echten Leuchtturm. Die meisten Türme jener Zeit dienten nur dem Ausblick. Dieser hier leitete zusätzlich Schiffe, und lange wurde er als höchster Leuchtturm der Welt geführt. Auch seine Form ist Teil der Geschichte. Türme jener Epoche hatten meist kantige Ecken, dieser hat dagegen zehn Seiten. Das bedeutet, dass er von jedem Blickwinkel fast gleich aussieht. Im Jahr 1961, als es in der Umgebung nur wenige hohe Gebäude gab, war seine markante Silhouette vom Hafen und von vielen Teilen der Stadt aus zu sehen. Auch der Leuchtturm veränderte sich im Laufe der Jahre. Im Jahr 1989 wurde er in Yokohama Marine Tower Lighthouse umbenannt, mit einem roten oberen Abschnitt, einem weißen unteren Abschnitt und einer gitterartigen Konstruktion. Die Verwaltung des Leuchtturms ging 2007 an die Stadt Yokohama über, und sein Dienst als Leuchtturm, der etwa 50 Jahre gedauert hatte, endete 2008. Im Jahr 1990 wurde eine farbige Beleuchtung fertiggestellt, sodass der Turm nach Einbruch der Dunkelheit nicht nur tagsüber, sondern auch als leuchtendes Wahrzeichen erschien.