Agora observe a própria arquitetura. O conjunto segue o estilo shinden-zukuri, o modo das residências aristocráticas do período Heian. Nessa tradição, um edifício principal, o shinden, fica voltado para um jardim ao sul. No Santuário Itsukushima, o jardim foi substituído pelo mar, uma forma notável de adaptar uma casa nobre. Os edifícios se apoiam em altas estacas de madeira e são unidos por longos corredores. Pavilhões e um palco de noh ficam entre eles, e cada elemento estrutural é pintado de vermelho-cinábrio. O santuário tem as partes padrão de um conjunto xintoísta, mas são incomuns em escala. Há um honden, o salão principal, um haiden, o oratório principal, e um heiden, o salão de oferendas. O haiden e o heiden são excepcionalmente longos. O honden é uma estrutura de oito por quatro vãos, com telhado de casca de cipreste no estilo kirizuma. O design também reflete uma longa tradição da construção japonesa. As estruturas do período Heian tendiam a acompanhar o entorno, deixando que árvores, água e a beleza natural se tornassem parte do projeto. Na maré alta, os salões parecem flutuar, e na maré baixa as estacas e a costa ficam expostas. Vale a pena ver as duas situações.