Gehen wir zurück ins Jahr 1859. Japan hat sich dem Außenhandel geöffnet, und Nagasaki erhält eine ausländische Siedlung. Französische katholische Priester der Pariser Missionsgesellschaft kommen, um die ausländischen Bewohner zu betreuen. Pater Furet traf am 22. Januar 1863 in Nagasaki ein und stellte fest, dass die Siedlung bereits von Kaufleuten überfüllt war. Land war schwer zu finden, doch mit Hilfe des Stadtvogts von Nagasaki sicherte er sich ein Grundstück neben der Siedlung Oura Minamiyamate. Er sammelte Spenden, verkehrte mit der ausländischen Gemeinde und bereitete den Boden selbst vor. Der Baumeister war Koyama Hidenoshin, ein Handwerker aus Amakusa, der bereits an der englischen Kirche im Stadtteil Higashiyamate gearbeitet hatte. Die Kirche wurde Ende des folgenden Jahres fertiggestellt und offiziell als Kirche der Sechsundzwanzig Märtyrer Japans benannt. In Japan werden Kirchen gewöhnlich nach ihrem Ortsnamen genannt, daher wurde sie schlicht als Oura bekannt. Die feierliche Weihe leitete Bischof Girard zusammen mit den Missionaren Petitjean und Laucaigne. Kapitäne von französischen, russischen, britischen und niederländischen Schiffen im Hafen nahmen teil, jeder brachte einige katholische Seeleute mit. Die Widmung an die Sechsundzwanzig Märtyrer ist ein Bekenntnis. Am 5. Februar 1597 wurden 26 Christen in Nishizaka in Nagasaki hingerichtet, die erste Verfolgung des Christentums, die von einem nationalen Herrscher angeordnet wurde, Toyotomi Hideyoshi. Die Kirche wurde so errichtet, dass sie zu diesem Ort blickt, sodass das Gebäude über zweieinhalb Jahrhunderte hinweg auf diese Ereignisse zurückschaut.