Pour comprendre ce théâtre, imaginez le lit asséché de la rivière Kamo, près de Shijo, quelques années après la bataille de Sekigahara. En 1603, une femme nommée Izumo no Okuni, qui se présentait comme une prêtresse de sanctuaire originaire d'Izumo, présenta sa danse kabuki à Kyoto. Les foules furent captivées, et des imitateurs suivirent bientôt avec des spectacles de kabuki féminin. La rive de Shijo devint un quartier de théâtres animé. Les autorités finirent par regrouper les salles de spectacle sur le côté est de la rive de Shijo et en reconnurent sept officiellement. La tradition veut que cela se soit produit à l'époque Genna, entre 1615 et 1623, sous l'autorité du gouverneur adjoint de Kyoto. Le Minami-za est issu de l'une de ces sept salles autorisées, alors appelée simplement la salle du sud. Le nom relève de la simple géographie : le théâtre se trouvait du côté sud de la rue Shijo, tandis que son rival se dressait au nord. Les incendies détruisirent les salles à maintes reprises, et le centre du monde du théâtre glissa vers Osaka. Au début du XIXe siècle, il ne restait qu'une salle de chaque côté de la rue Shijo. Lorsque la rue Shijo fut élargie dans les années 1890, la salle du nord, Kita-za, ferma. Dès lors, le Minami-za resta seul, et il est depuis le théâtre kabuki de Kyoto.