Su visita comienza en la segunda planta, en el vestíbulo de entrada y bienvenida. La tercera planta alberga el rincón de la Historia de los Transbordadores del Seikan, la Sala de Exposición de Mecanismos del Barco, un rincón de biblioteca, un rincón de nudos náuticos y un salón junto al mar. También se exhiben asientos reservados de primera clase restaurados y asientos ordinarios, para que pueda sentarse donde se acomodaban los pasajeros durante la travesía. La cuarta planta es el punto culminante para muchos visitantes. La timonera, desde donde el capitán gobernaba el barco, y la sala de radio se conservan tal como estaban durante los días de trabajo del transbordador, e incluso se le permite tocar los instrumentos de navegación. Esas pesadas esferas y controles facilitan imaginar el estrecho de noche. El salón ocupa estancias que antes usaban el capitán y los oficiales, y desde aquí tiene una amplia vista del puerto de Hakodate y del monte Hakodate. El Mashu-maru fue uno de los transbordadores que cerraron la era del Seikan, junto con el Hachikoda-maru, el Daisetsu-maru, el Yotei-maru, el Towada-maru, el Sorachi-maru, el Hiyama-maru y el Ishikari-maru, y al estar frente a esa ventana está mirando el mismo puerto al que aquellos barcos llegaban tras cruzar.