A partir de 2002 el zoológico comenzó a renovar sus viejas jaulas, avanzando hacia espacios abiertos y recintos tipo hábitat en lugar de jaulas estrechas. Luego, el 29 de mayo de 2017, cerró por completo para poder reconstruirse junto con el Parque de Hsinchu. Reabrió el 28 de diciembre de 2019, y a la ceremonia de inauguración asistió la presidenta Tsai Ing-wen, quien recorrió el recinto con el alcalde de entonces, Lin Chih-chien. El nuevo zoológico se basa en tres ideas centrales: el bienestar animal, la educación y la recreación. En la práctica, eso significa abrir las jaulas, dar a los animales más espacio, recuperar algo de sus hábitats naturales, dietas equilibradas y un sistema médico adecuado. Invierte la antigua idea de animales que se observan encerrados en una jaula. Los visitantes respondieron con gran entusiasmo. Más de 20 000 personas acudieron el primer día, y unas 370.000 en el primer mes, una cifra récord. La colección en 2020 era de unas cincuenta especies y 250 animales, entre ellos hipopótamos, osos malayos, orangutanes, tigres de Bengala, gibones, flamencos y macacos de Taiwán.