El patrimonio católico de Fira se distingue con facilidad y es maravillosamente colorido. La Catedral Católica de San Juan Bautista se levanta en el barrio católico, en la parte norte de la ciudad, muy cerca de la iglesia ortodoxa. Es una basílica de tres naves con cúpula, de estilo barroco, con un campanario ornamentado y un esquema de colores melocotón y azul, poco habitual en la isla, que destaca frente a los edificios blancos. En el interior, la cúpula es de un azul lila, con otras partes en naranja y crema. La catedral sufrió grandes daños con el terremoto de 1956 y fue restaurada en 1975, un recordatorio de cuán estrechamente ligada está la historia de Fira al suelo que tiembla. Sobre los acantilados también encontrarán las Tres Campanas de Fira, oficialmente la Iglesia Católica de la Dormición, una iglesia greco-católica oriental de estilo bizantino conocida por su cúpula azul, sus tres campanas y sus vistas. A mediados del siglo XVII se construyeron aquí dos modestas iglesias excavadas en la roca del acantilado. Con el tiempo fueron destruidas a medida que el acantilado retrocedía, y en el lugar se edificó una enfermería antes de la iglesia actual.