Entren y la iglesia se convierte en una galería de arte florentino. A lo largo de los siglos, muchos de sus frescos originales fueron destruidos a raíz de la Contrarreforma, pero todavía se percibe la antigua decoración. En la cara interior del muro de la fachada se encuentra una Anunciación de Pietro Miniato, pintor e iluminador que se dice que se hizo cargo de un taller que antes perteneció a Giotto. Su estilo es elegantemente gótico y ricamente decorado, al modo del arte cortesano. En la Capilla Strozzi se encuentra el Retablo del Redentor, un políptico pintado por Andrea Orcagna en 1357. Y ya fuera, las arcadas góticas a lo largo de la fachada estaban destinadas a alojar sarcófagos. Una de ellas es el lugar de descanso del pintor renacentista Domenico Ghirlandaio. La iglesia también tuvo un papel en los asuntos mundiales. En 1439 fue elegida como sede del primer concilio que buscó reunir a las iglesias ortodoxa y católica, y se convirtió en un lugar predilecto de los papas. Junto a la iglesia, los claustros y el refectorio albergan hoy pinturas, ornamentos sagrados, orfebrería y reliquias, y la farmacia de Santa Maria Novella, anexa al conjunto, es célebre por ser la más antigua de Europa.