L'existence même de ce magnifique édifice résulte d'un scandale royal. Au milieu du XIe siècle, Guillaume le Bâtard, duc de Normandie, chercha à épouser sa cousine, Mathilde de Flandre. Cependant, le pape Léon IX interdit strictement l'union pour des raisons de consanguinité, signifiant qu'ils étaient trop proches parents. Défiant le Saint-Père, ils se marièrent tout de même vers 1053. Il fallut des années de manœuvres diplomatiques pour apaiser le conflit avec l'Église. En geste d'expiation, le couple accepta de fonder deux grands monastères à Caen : on les appelle souvent les abbayes jumelles. Tandis que Guillaume érigeait l'Abbaye aux Hommes à l'ouest, Mathilde fondait ce site pour des moniales bénédictines. C'était son projet personnel et un témoignage de sa dévotion. Aujourd'hui encore, les proportions élégantes et légèrement plus délicates de cette église reflètent l'héritage de la Reine qui survécut aux empires et vit son mari se couronner le jour de Noël 1066.