Als sich das Museum 2007 im Tokyo Midtown niederließ, gestaltete der Architekt Kengo Kuma die Räume neu. Kuma ist dafür bekannt, natürliche Materialien in zeitgenössische Gebäude zu bringen, und hier verwendete er großzügig japanische Materialien wie Holz und japanisches Papier. Das Ergebnis ist ein entspannter, moderner japanischer Raum mit natürlicher Wärme. Er liegt innerhalb eines belebten urbanen Komplexes, in einem Gebiet, das für Wolkenkratzer, Luxusgeschäfte, Restaurants und Hotels bekannt ist, doch der Innenraum soll Sie beruhigen statt überwältigen. Achten Sie beim Hindurchgehen auf die Oberflächen. Weiche, warme Flächen passen zum stillen Betrachten, das alte japanische Kunst verlangt. Hier steckt eine stimmige Logik. Viele Objekte der Sammlung wurden aus denselben Materialien gefertigt, für Räume und den täglichen Gebrauch. Sie in einer Umgebung zu sehen, die diese Materialien aufgreift, lässt die alten Dinge ein wenig mehr wie zu Hause wirken.