Il momento più determinante nella lunga storia di questa cattedrale avvenne la sera del 29 dicembre undicissette. All'interno del transetto nord-est, quattro cavalieri — agendo sotto l'influenza delle parole frustrate di Re Enrico II — affrontarono l'arcivescovo Thomas Becket. In un atto brutale che scioccò tutta l'Europa medievale, lo uccisero proprio qui sul pavimento della cattedrale. Becket fu rapidamente dichiarato santo e la sua morte trasformò Canterbury in una delle destinazioni di pellegrinaggio più importanti d'Europa, ispirando infine Geoffrey Chaucer a scrivere "I racconti di Canterbury". Oggi è possibile visitare il Martirio, il punto esatto dell'omicidio, contrassegnato da una suggestiva scultura moderna di due pugnali rivolti verso il basso. Sebbene il magnifico santuario ricoperto d'oro dedicato a San Tommaso sia stato distrutto da Re Enrico VIII nel quindecentotrentotto, un'unica candela arde ora nella Trinity Chapel per indicare il luogo in cui sorgeva, offrendo un momento di silenzio per riflettere su una storia di potere, amicizia e tradimento.